Shaolin Xu

Genomic adaptation of the water flea Daphnia to elevated temperatures: Insights from power plant‐heated lakes

Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 +0000

High-quality genome of Diaphanosoma dubium provides insights into molecular basis of its broad ecological adaptation

Sun, 01 Jan 2023 00:00:00 +0000

Toward a phylogeny and biogeography of Diaphanosoma (Crustacea: Cladocera)

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

Development of microsatellite markers for Diaphanosoma dubium (Crustacea, Cladocera) and application to seasonal population dynamics

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

Mitogenomics of Cladocera (Branchiopoda): Marked gene order rearrangements and independent predation roots

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

Geographic Variation of Phyllodiaptomus tunguidus Mitogenomes: Genetic Differentiation and Phylogeny

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

Application of COI Primers 30F/885R in Rotifers to Regional Species Diversity in (Sub)Tropical China

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

A new set of highly efficient primers for COI amplification in rotifers

Fri, 01 Jan 2021 00:00:00 +0000

The mitochondrial genome of Phyllodiaptomus tunguidus Shen & Tai, 1964 (Copepoda, Calanoida) and its phylogeny

Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 +0000

A set of new primers for COI (cytochrome oxidase subunit 1 mitochondrial gene) amplification in Phyllodiaptomus tunguidus (Copepoda, Calanoida, Diaptomidae)

Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 +0000

Urbanization increases biotic homogenization of zooplankton communities in tropical reservoirs

Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 +0000

A global analysis of cladoceran body size and its variation linking to habitat, distribution and taxonomy

Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 +0000

Mitogenome of Daphnia laevis (Cladocera, Daphniidae) from Brazil

Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 +0000

Comparative analysis of rotifer community structures in two pumped-storage reservoirs with different retention times

Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 +0000

Daphnia diversity on the Tibetan Plateau measured by DNA taxonomy

Mon, 01 Jan 2018 00:00:00 +0000

The mitochondrial genome of Atrocalopteryx melli Ris, 1912 (Zygoptera: Calopterygidae) via Ion Torrent PGM NGS sequencing

Mon, 01 Jan 2018 00:00:00 +0000

Species and hybrids in the genus Diaphanosoma Fischer, 1850 (Crustacea: Branchiopoda: Cladocera)

Mon, 01 Jan 2018 00:00:00 +0000

The mitochondrial genome of Diaphanosoma dubium with comparison with Daphnia magna

Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 +0000

A new set of primers for COI amplification from purpleback flying squid (Sthenoteuthis oualaniensis)

Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 +0000

Spatial heterogeneity and long-term dynamics of cladoceran ephippia in a monsoonal reservoir, driven by hydrology and eutrophication

Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 +0000

Haplotype diversity and genetic differentiation of dormant and active populations of Daphnia galeata in Liuxihe Reservoir of Guangdong Province, southern China

Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 +0000

Temporal and spatial variation of the community structure of rotifers in Dashahe Reservoir, southern China (Guangdong province)

Sun, 01 Jan 2017 00:00:00 +0000

盔型溞 (Daphnia galeata) 四个地理种群遗传多样性及分化的 RADP 分析

Thu, 01 Jan 2015 00:00:00 +0000

FraGen：基于 eDNA 评估联邦水道中鱼类种群遗传破碎化的方法

Tue, 03 Nov 2026 00:00:00 +0000

德国联邦水文研究所（BfG），U4 部门。当前项目。

欢迎来到我的网站

Tue, 03 Nov 2026 00:00:00 +0000

这个网站的用途，以及我会写些什么。

盔形溞（Daphnia cucullata）对升温的基因组适应

Mon, 31 Aug 2026 00:00:00 +0000

来自电厂热排水湖泊的证据。Limnology and Oceanography，2026。

bioinfo_container

Tue, 19 Aug 2025 00:00:00 +0000

用于群体遗传学分析的 R Docker 镜像。

FastAPI 的 @app.delete 真的会删除数据吗？

Wed, 09 Jul 2025 00:00:00 +0000

@app.delete 只是声明一个处理 DELETE 请求的函数，删不删数据、删完做什么，都由你自己写。

Mac 上的 Windows App 连不上 Ubuntu 的 RDP 远程桌面

Wed, 09 Jul 2025 00:00:00 +0000

Ubuntu 已开启远程登录，但连接仍然失败。解决办法是改导出的 .rdp 文件里的一行。

在 oh-my-zsh 提示符里显示 IP 地址

Thu, 03 Jul 2025 00:00:00 +0000

用一个小函数把当前 IP 地址放进 ys 主题的提示符，macOS 和 Linux 都适用。

青藏高原的溞类（Daphnia）

Fri, 31 Dec 2021 00:00:00 +0000

大型溞与西藏溞的群体基因组学与谱系地理学（博士，2016–2021）。

枝角类的系统发育基因组学

Sat, 31 Jul 2021 00:00:00 +0000

枝角类（甲壳动物：鳃足纲）的系统发育基因组与线粒体基因组研究，2018–2021。

关于

Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000

我目前在德国科布伦茨的联邦水文研究所（Bundesanstalt für Gewässerkunde，BfG）工作，参与 FraGen 项目：开发并验证一套非侵入式的 eDNA 框架，用于评估德国联邦水道中本地关键鱼类的遗传多样性与种群破碎化，了解水坝、堰等水利设施如何减少基因流，鱼道是否真正恢复了遗传交流，并为基于证据的水道管理提供支持。

联系

Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000

欢迎对水蚤基因组学、eDNA 与群体遗传学感兴趣的合作者和学生与我联系。

履历

Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000

技术技能

**浮游动物：**枝角类与轮虫的野外采样、室内培养与分类
**DNA：**提取、PCR、引物设计
**生物信息学：**基因组组装、Hi-C、转录组组装、基因组注释、功能富集分析
系统发育学与系统发育基因组学
**群体遗传学与基因组学：**微卫星、SNP 分型、遗传多样性与结构、种群历史、基因型–环境关联
**编程：**Python、R、Bash
**Linux：**服务器管理与维护

访学经历

2019 年——捷克 Český Krumlov：基因组学与系统发育基因组学工作坊（1 个月），期间短访比利时 KU Leuven（2 周）
2018 年——意大利国家研究委员会生态系统研究所（3 个月）
2016 年——比利时根特大学（1 个月）

语言

中文——母语
英语——优秀